基因启动子生物信息学【人ALK-1近端启动子的生物信息学分析】

来源:工作总结 发布时间:2019-03-30 点击:

  [摘要]目的:对人ALK-1启动子进行生物信息学分析。方法:从Genebank获取人类基因组序列和人ALK-1 mRNA序列,使用Pi,stEF程序分析并获得ALK-1近端启动子序列,并使用Matlnspector程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测。结果:使用PirstEF程序成功获得了长度为1Kb的人ALK-1近端启动子序列。Hatlnspector程序分析该启动子中共含有136个顺式转录调控元件,包括多种早期生长反应基因家族成员、Myc相关锌指蛋白家族成员和Ets家族成员等。值得注意的是在ALK-1启动子中含有6个KLF6结合元件,提示ALK-1参与创面愈合和组织重建过程。结论:获得了人ALK-1近端启动子的转录调控信息,推测KLF6可强烈诱导ALK-1基因表达。
  [关键词]ALK-1,启动子,生物信息学
  [中图分类号]R619.6 [文献标识码]A [文章编号]1008―6455(2005)02―0149―03

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